单链DNA（ssDNA）包括环状单链DNA（cssDNA）和线性单链DNA（lssDNA）两种。其应用目前主要集中在以下两个领域：

1、随着CRISPR/Cas9基因编辑技术的兴起，ssDNA因其片段敲入效率高、能有效避免双链DNA（dsDNA）片段在基因组中随机插入的问题等优势，在基因敲入领域得到了广泛应用。宜明独立开发了可制备长链或超长链的ssDNA的新工艺，相较于传统的外切酶工艺，可以有效的避免长链ssDNA被外切酶非特异切割活性引入的不完整性和外切酶消化不彻底引入的局部双链问题。

2、ssDNA还在新兴的DNA折纸（DNA origami）技术中被广泛使用，通过长的单链DNA支架与数百条与之互补配对的短链DNA（通常20-60 bp）相互配对后，折叠成一定形状的一维、二维、三维纳米物体，以及可变化的DNA折纸结构。这些DNA纳米材料具有很好的生物相容性、精确的可寻址性以及稳定性等自身优势，因此这些DNA微观结构可以作为一种纳米材料应用在各个领域，如靶向递送、纳米材料加工等。